工程挂靠协议注意事项：
1、挂靠人与被挂靠人之间引起纠纷的主要原因是拖欠工程价款或者管理费；
2、发包人与实际施工人(挂靠人)的法律关系。根据合同相对性原则，合同的权利义务只在合同当事人之间产生，只对合同当事人具有法律约束力，而不及其他人。
【法律依据】
《民法典》第五百零二条
依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。